Il trapianto di sopracciglia viene eseguito con la logica di trapianto di capelli mediante FUE. La procedura viene eseguita in anestesia locale e dura circa 3-4 ore. I follicoli piliferi prelevati dalla zona della nuca vengono utilizzati nel trapianto di sopracciglia. Questi follicoli vivi devono essere posizionati in una certa angolazione e direzione seguendo la forma scelta in precedenza nell'area da trapiantare. I follicoli piliferi escono dalla pelle con un angolo di 45 gradi. Le sopracciglia invece escono dalla pelle con un angolo di circa 10-15 gradi. Hanno una forma che punta verso l'alto nella parte interna del sopracciglio, una forma parallela quando arrivano al centro e leggermente verso il basso nella parte esterna del sopracciglio. Per questo motivo si deve prestare massima attenzione nel creare microcanali durante il trapianto. Altrimenti, il sopracciglio potrebbe essere trapiantato in modo errato e fuoriuscire quindi in modo diverso, nella direzione opposta o verso il basso. Perciò il trapianto di sopracciglia è una procedura che dovrebbe essere eseguita da un team di esperti.